1、为了保护考生的利益，减少退档矛盾，平行志愿投档比例不超过公布招生计划数的105%（具体比例由招生院校确定）。
2、平行志愿投档按照分数优先，遵循志愿的原则进行。投档时从高分到低分、逐分逐个地按顺序检索考生填报的A、B、C、D 4个院校志愿。
3、为了减少按照投档比例投档时，最低分总分相同考生一同被投档到同一所志愿院校面临的退档风险，保护好考生利益，在对考生分别按文理总分从高到低排序时，若总分相同，再按文、理科不同的单科顺序进行排序：文科的科目顺序依次为语文、外语、数学、综合；理科的科目顺序依次为数学、外语、语文、综合。
4、2008年上海市普通高校招生二本批次各校投档分数线表中，最低分为各校投档考生中成绩最低值，同时附文科投档最低分对应的语文、外语、数学、综合科目和理科投档最低分对应的数学、外语、语文、综合科目等单科科目的成绩。若填报同一所院校的多位考生的总成绩刚好都是该校投档最低分，则通过按科目顺序比较单科成绩来确定哪些考生可投档该校，第一个单科科目成绩相同，则再比较下一个。比如，二本批次各校投档分数线表中，上海交通大学的文科投档最低分为473分，语文106分，外语111分，数学112分，综合21分，若有两个文科考生A志愿都报考上海交通大学，总成绩刚好都为473分，这时只剩一个计划指标可投上海交通大学，按顺序检索，则要看其语文成绩，若一个106分，另一个98分，则语文为106分者能投档至上海交通大学，另一人则投不进；若二人语文恰好又全部是106分，则比较其外语成绩，比较方法与语文相同，以此类推。
5、部分认可本市实行加分投档政策的外地高校，最低分可低于本市公布的第二批本科最低录取控制分数线达20分，即文科最低可达408分，理科最低可达379分。
