创新型人才是建设创新型国家的生力军。山东大学以培养富有创造力的优秀人才为目标，大力实施以“一个学生、两个导师、三种经历”为重点的博士生培养模式创新，注重提高博士生培养质量，积极培养创新型人才。
“一个学生”——个性化培养与重点培育相结合，提高博士生创新能力。一是优化博士生培养方案。学校结合经济社会发展和科技进步修订完善研究生培养方案，注重发挥博士生个人才能和特长，在满足培养方案基本要求基础上，博士生可根据个人实际情况，对课程选择、科研实践及学位论文选题等进行不同安排。二是强化过程管理。加强和改进前沿讲座和文献综述等课程的教学，适当减少博士课程学分，增加实践环节学分和“研究计划”书写水平方面课程的学分，引进并实施国外优秀教学计划。推进英语教学和专业课双语教学改革，注重应用能力培养，鼓励博士生用外语作前沿报告，在理工医类博士生中全面实行双语撰写学位论文。三是实施优秀博士生培育计划。为使更多的优秀博士学位论文进入国家和省优秀论文的行列，学校专门设立“优秀博士研究生培育基金”，制定了《优秀博士研究生培育计划》，重点支持培育具有创新潜质、有望取得突破性研究成果的优秀博士生。学校还设立“优秀博士学位论文奖”、“优秀博士学位论文指导奖”和“优秀人才培养奖励基金”，每年对获得全国、山东省和学校优秀博士学位论文奖的作者及其指导教师进行表彰和奖励。2000年以来，学校先后有15篇博士学位论文获“全国优秀博士学位论文”奖。
“两个导师”——实行双导师制，优化博士生导师队伍。“两个导师”即导师加合作导师，合作导师包括校内跨学科合作导师、海外高水平大学合作导师、国内大学或科研机构合作导师、企业或政府机构合作导师。为提高博士生导师队伍的质量与水平，学校着力建设三支博士生导师队伍：校内博士生导师、兼职博士生导师、合作博士生导师。学校进一步修订了《山东大学遴选博士生指导教师实施细则》，出台了《山东大学研究生合作导师遴选办法》，提高了博士生导师的上岗标准和招生条件，加强了对新任博士生导师的岗前培训。并积极探索导师遴选制度改革，开展了导师资格认定试点工作。自2006级博士生开始，学校充分利用校、内外教育资源，实施双导师制，每位博士生导师至少有1名研究生实行双导师培养，积极鼓励进行跨专业、跨学科的联合授课与合作指导，提高研究生理论与实践相结合的能力。2007年，第一批聘任的66名博士生合作导师已经上岗。
“三种经历”——推进开放式培养模式，拓展博士生学术视野和实践经历。一是鼓励海外经历。自2005年学校每年设立500万元“研究生海外留学基金”，重点资助优秀研究生特别是博士生到国外一流大学，跟随一流导师从事科学研究和课程学习，支持博士生参加国际学术会议和国际暑期学校。学校还与法国国立统计与经济管理学院、国立路桥学院及巴黎综合理工大学等3所院校签署联合培养金融数学硕士的合作协议，并参与中国和法国联合培养博士生的项目。2005年以来，中外联合培养研究生已达377人的规模，其中博士生222名。二是增加“第二校园”经历。与厦门大学、武汉大学等13所国内高校研究生院及中科院、社科院等院所建立研究生访学制度。每年设立30万元“研究生国内访学基金”，资助博士生到国内相应重点学科、重点实验室进行课题研究和学术交流。三是扩大社会实践经历。学校加强与地方政府、大型企事业单位合作，建立了以信息、工程、管理，医药卫生等为主的研究生培养基地，组织博士生科技服务团赴山东省各地市开展科技服务、医疗援助和文化服务等活动，并围绕企业存在的技术难题，开展项目攻关。2007年，山东大学邹平新农村研究生创新实践基地、青岛考古实践基地、青岛市立医院医学研究生实践基地、烟台东方电子研究生科技创新实践基地相继成立。
