云南农业职业技术学院于2002年12月17日经云南省人民政府云政复[2002]134号文件批准，由云南省农业学校和云南省 畜牧兽医学校两校合并组建成立。学院分茭菱路校区和小哨校区，是我省唯一一所由两所省部级重点中专合并组建的公办高等农业职业技术学院，两校在多年的中专办学过程中，坚持为“农业、农村、农民”服务的方向，不断深化教育改革，调整专业结构，主动适应市场经济发展的需要，为云南省农业和农村经济建设培养了大批农牧业科技人才，为我省农业和畜牧业的发展做出了重要的贡献。两校办学历史悠久，云南省农业学校始建于清光绪30年（公元1904年），“首开云南省职业教育的先河”，云南畜牧兽医学校1958年由省农校分出组建。近几年均与高校联办大专班，具有举办高等职业教育的经验。
学院占地面积：1105亩，校舍建筑面积：76223平方米，图书馆藏书总量12万余册，现有实验室52个。有新建多媒体计算机教室2个和普通计算机室4个，语音室2个，电教室3个，有联接宽带网的电子阅览室和备课中心。校外有多个教学实习基地，校内有实习农场和实习牧场等 实习基地570亩，并可利用省优质农产品开发服务中心肉牛中心等省农业厅所属的企事业单位实习，还可利用省农业厅各技术推广站（所）深入到基层实习。现有专任教师141人，其中：高级讲师30人，讲师72人，大学本科及其以上学历117人，研究生和在读研究生15人，中级技术职务以上的“双师型 ”专任教师22人。
学院现有在校中专生２５００余人，有较成熟的专业设置，开设了畜牧兽医、动物防疫检疫、草原与饲料、兽药生产与检测、畜牧、草坪生产与经营、兽医、农业推广、园艺、园林花卉、淡水养殖、农牧业经济管理、计算机及应用等多个专业。这些专业的建设已取得了很大的成就，并经历了多年的市场考验，符合农业和农村经济的发展需要。在深化教学改革过程中，逐步调整教学计划和专业结构，改革招生办法，不断扩大招生数量，积极探索中专与大专、职高、函授、短期培训相结合的多种办学形式，探索教学、科研、生产、经营和服务“五位一体”的办学模式，进行能力体系教学的改革试点，积极为“三农”服务，收到了很好的效果。历任领导从严治校，严谨治学，使学校形成了“团结，奋进，求实，创新”的良好校风，并积累了丰富的办学经验。在农业部及云南省教育厅组织的历次办学水平评估中均得到专家组的好评。
学院现经云南省教育厅批准，同意从今年起开办畜牧兽医、动物防疫检疫、农业推广、园林绿化等４个三年制（高职）专科专业和园林绿化、现代园艺、畜牧兽医、饲料加工等４个五年制（高职）专科专业及园艺、园林花卉、草坪生产与经营、畜牧、兽医、畜牧兽医、淡水养殖、兽药生产与检测、动物防疫检疫、农业推广、牧业经济管理、农村经济管理、计算机及应用、文秘档案（办公自动化）等１４个中专专业。
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