上海水产大学是一所以海洋、水产、食品、渔业经济与法规等特色学科为主，农、理、工、经、文、管等学科协调发展的多科性大学。其前身是1912年由著名教育家黄炎培，著名民族实业家、教育家张謇等发起创立的江苏省立水产学校（俗称吴淞水产学校）。历史上还曾先后使用过国立第四中山大学农学院水产学校、国立中央大学农学院水产学校、上海市吴淞水产专科学校、上海水产专科学校、上海水产学院、厦门水产学院等校名。1952年成为国内第一所本科水产高校，1985年由国家农牧渔业部定名为上海水产大学，2000年起由中央与地方共建、上海市主管，是国内水产类学科、学位、专业设置最齐全的大学，是上海市拥有教育部重点学科的13所高校之一。
学校下设9个学院、5个研究中心，即渔业学院、海洋学院、食品学院、经济贸易学院、信息学院、人文学院、成人教育学院、高等职业技术学院、爱恩学院（中澳合作）；渔业发展战略研究中心、海洋科学与技术研究中心、食品科学与技术研究中心、生物技术研究中心、水环境研究中心。另设有农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室（原农业部水产增养殖生态生理重点开放实验室）、农业部冷库及制冷设备质量监督检验测试中心、农业部远洋渔业培训中心、中央农业干部教育培训中心上海水产大学分院（原中央农业干部管理学院上海水产大学分院）、农业部渔政管理干部上海培训中心，以及由著名鱼类学家、中国鱼类学主要奠基人、一级教授朱元鼎先生创建的鱼类研究室和标本室。此外，还建有水产动植物病原库、捕捞航海雷达模拟实验室、资源环境遥感实验室、淡水渔业资源利用实验室等特色实验室。
学校教学用地818.5亩，其中军工路校区212亩、学海路校区225亩、南汇水产养殖实验基地384亩、浙江奉化研究实习基地7.5亩。现有国家一级学科“水产”博士学位授予权（涵盖水产养殖、捕捞学、渔业资源3个二级学科博士点）、14个硕士点（包括农业推广硕士专业学位授予权）、23个本科专业、18个专科专业；水产养殖国家级重点学科；水产养殖、捕捞学2个上海市重点学科；水产养殖、捕捞学、水产品加工及贮藏工程3个农业部重点学科。2002年本专科学生达10000余人，博士、硕士研究生达450多人，成人教育学生3700多人。全校教师中有高级职称者200人。校图书馆藏有以水产为特色的书籍46万册。2000年5月，经国家教育部批准，水产养殖学、生物科学、海洋渔业科学与技术、食品科学与工程、热能与动力工程、农林经济管理6个专业被列为国家管理专业。
学校最早在全国设立了水产品加工、罐头制造、水产品综合利用、工业捕鱼、海洋渔业、渔业资源、渔具力学、渔业机械、渔业电子，淡水渔业与管理、海水养殖、鱼类学，渔业经济等专业。率先在全国开设的课程、编著的教材有：渔具理论与计算一般原理、渔具力学、声光电渔法，渔业资源生物学、渔业资源评估，鱼类学、鱼病学、水产增养殖学、鱼类生理学、藻类学，国际渔业、渔业经济学、冷藏工艺学、助渔导航仪器等。
学校在鱼类学、水产增养殖、水产动物种质资源、水产动植物病害防治、水产动植物苗种、水产动物生物技术、海洋生态、水生生物、水域环境、海洋渔业科学与技术、渔业工程、渔业资源、渔业管理、渔业经济、水产品加工与贮藏工程、食品科学与工程、制冷与低温工程、机械工程、渔业法规与政策、渔业经济等领域取得明显优势。1978年以来共获得数百项研究成果和数十项专利技术，其中100多项获国家和省部级科研成果奖，产生显著的经济和社会效益。
学校在产学研相结合、教学改革与实践、大学生素质教育等方面获得多项教学成果奖，其中“海洋渔业专业的教学改革和实践”（主持）获1997年国家级教学成果一等奖，“海洋渔业科学与技术人才培养模式研究及教学改革实践”（主持）、“普通高等农林院校教学工作评价研究与实践”（参与）获2001年国家级教学成果二等奖。1996-1999年连续四年被中宣部、教育部、团中央联合授予暑期社会实践先进单位。
学校与日本东京水产大学、三重大学、东北大学、长崎大学、高知大学，美国华盛顿大学、罗德岛大学、康涅狄格大学、马里兰大学、奥本大学、布里奇波特学校，韩国釜庆大学、济州大学、丽水水产大学，澳大利亚塔斯马尼亚大学、南昆士兰大学、国立海洋学院，越南国家水产部、芽庄水产大学，俄罗斯加里宁格勒科技大学、远东渔业经济学院等国家和地区的40多所高等院校、研究机构有长期学术往来和合作交流，长期参与中美海洋生物资源合作计划，每年派遣优秀高年级本科生赴日、韩短期留学；与联合国粮农组织、教科文组织、渔业信息中心，加拿大国际开发研究中心，瑞典国际科学基金会，亚洲水产学会，国际水生生物资源管理中心等国际组织建立了长期友好合作关系。2002年，越南国家主席陈德良特授予我校友谊勋章，以表彰我校在培养越南留学生方面所做的突出贡献。
为适应中国入世后的全球化竞争，促进中国渔业经济从数量向效益转变，为社会输送复合型高层次水产人才，作为中国起步最早的高等水产学府，上海水产大学提出了新时期的办学目标，即努力实现跨越式发展，把上海水产大学建设成为一所国内外知名、特色学科优势明显、多学科协调发展、教学科研并重的一流特色大学。
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