南方医科大学是一所全国重点大学。北校区地处广州市风景秀丽的白云山东麓，南校区地处广州市东南（新会展中心附近），占地面积近百万平方米，建筑面积愈百万平方米。校园绿树成荫，花团锦簇，是广东省一级园林式院校。
专业学科门类齐全。设有临床医学八年制、临床医学、预防医学、中医学、中医学(中西医结合)、中药学、药学、医学影像学、生物医学工程（影像工程）、生物医学工程（医学信息工程）、医学检验（医学实验技术）、医学检验（临床检验）、护理学、法学（卫生监督与管理）、公共事业管理（卫生事业管理）、应用心理学（医学心理学）等16个本科专业。学科涵盖医学、工学、理学、法学、管理学五大领域，形成了以理工医结合、中西医结合、热带医学、生物高技术等为代表的优势学科群。拥有2个国家级重点学科，2个国家中医药管理局重点学科，1个国家级临床药理基地和1个国家级中医药理基地，1个全军重点建设学科，9个全军重点实验室，1个涉外医疗中心，4个全军医学专科研究所，10个全军医学专科中心，拥有基础医学和临床医学3个博士后科研流动站，4个博士学位授权一级学科，32个博士学位授权点，50个硕士学位授权学科点。
学校师资力量雄厚。现有教师2151名，其中，正副教授700多名（博士生导师98多名，硕士生导师250多名），中国科学院和中国工程院院士2名，享受政府特殊津贴人员100多名，国家"973"项目首席科学家2名，国家学位评议组成员4名，国家级有突出贡献的中青年专家4名，军队重大贡献奖、长江学者特聘教授和全国骨干教师9名，有54人次先后获全国优秀科技工作者、全国优秀教师等荣誉，有100多名专家教授分别担任全军和全国性学术组织理事、常委以上职务。
办学设施配套完善。学校教学、科研、医疗、生活等基础设施配套完善，仪器设备精良。目前资产总值30亿多元人民币。有着良好的信息化教学环境，拥有装备现代的教学管理指挥中心和电化教学中心，基本实现形态学科实验显微录像化、机能学科实验微机化。教学场所齐全，现有各类教室108间、专业实验室119个，全部实现了空调化、网络化及电子化。新建的4人一间的本科生公寓实现了通电话、通网络、通电视，全部学员公寓可容纳15000名学生。拥有人工草皮的足球场和塑胶跑道的田径场。图书资料丰富，图书馆藏书近100万册，中外期刊2000多种约10万册。学校投资数千万元，建成能连通因特网和中国教育科研网的校园网络、先进的光盘检索系统和卫星介导的图书数据库信息检索网络，实现了图书信息资源共享。
教学科研实力雄厚。先后获得国家优秀教学成果一等奖1项，二等奖2项，军队教学成果一等奖7项。学校招生范围覆盖全国17个省市，本科学生大学英语四、六级统考通过率连续十年名列广东高校前列，"南粤优秀研究生"评选获奖率始终居广东高校第一。毕业生中涌现出"神舟载人飞船"系统航天医学工程总设计师、总指挥72级学员宿双宁和"973"项目首席科学家81级学员姜勇为代表的一大批高素质人才。学校每年所获科研课题和获奖数，均位居全国高等医科院校前列，在研各类基金课题893项，经费总额1亿5千多万元，其中"973"首席科学家项目2项，国家级重点课题53项；已获各类科技成果奖484项，其中国家科技进步奖16项，省部级一等奖22项。
医药技术特色鲜明。学校是现有两所附属医院，第一附属南方医院和第二附属珠江医院，共展开床位2500多张。设备精良，技术雄厚，在国内外有较大声望，特别在内窥镜诊疗、心血管介入诊治、器官移植、显微外科等方面，具有明显的特色和优势，现均已被评为三级甲等医院并捧得"白求恩杯"，南方医院还被评为全国"百佳医院"。1995年3月14日，中央军委签署命令，授予惠侨楼"模范医疗惠侨科"荣誉称号。
对外交往日趋频繁。学校广泛开展了学术交流活动，聘请了100余名国内外知名的专家和学者为我校名誉或客座教授。先后与美国、英国、日本、法国、澳大利亚及香港等20多个国家和地区的大学或科研机构建立了学术交流、科研合作等联系，现有来自10多个国家的留学生。已与军内外92家医疗机构和科研院校建立了联合培养人才的协作关系。
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